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组学数据模块化精细注释植物功能基因组
发布时间:2018年06月01日 
 

应生命科学学院邀请,扬州大学尤琪副教授来我校作学术报告,欢迎广大师生参加。

报告时间:20186414:00-15:00

报告地点:HC阶1

报告主题:组学数据模块化精细注释植物功能基因组

报告内容:

1、基于高通量多组学数据,采用共表达网络与聚类和功能富集分析相结合的策略,包括表达谱聚类、功能模块聚类、基因簇功能富集分析和顺式作用元件显著性分析,提出可行的模块化功能挖掘手段。利用该策略,多层面分析了二倍体和四倍体棉花基因功能在进化上的保守性和差异性,精细化了棉花基因组结构注释

2、基于原生质体瞬时转化体系,结合高通量测序数据,实现对CRISPR核酸酶基因组编辑效果的快速鉴定和评估

报告人简介

尤琪,博士,扬州大学紧缺型引进人才,副教授,2012年毕业于澳门金莎生命科学学院生物技术专业;2017年毕业于中国农业大学生物信息学专业,获理学博士学位,并取得北京市优秀博士毕业生和校级优秀博士学位论文奖项。

从事研究工作:利用功能基因组学和系统生物学等生物信息学手段,通过高通量组学数据整合分析,构建植物间模块化比较分析体系,以期提高功能基因的注释信息率、挖掘优良品质的关键调控基因和寻找主要调控机制等。此外,结合表观基因组学,对植物染色质结构动态解析,研究多组学因子对于基因的共调控作用。并利用高通量基因组测序数据,解析CRISPR-Cas9/Cpf1系统在植物基因组编辑中的有效运用,为现代农业分子育种提供理论指导。

至今,以第一作者在国际知名期刊《核酸研究:Nucleic Acids Research》、《分子植物:Molecular Plant》上发表学术论文7篇,累积影响因子达40;获得软件著作权4项。此外,与国内外多家单位合作发表高质量论文,主要负责生物信息方面分析,研究对象包括拟南芥、水稻、棉花、谷子、高粱、月季等多种重要模式植物和经济作物。

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